Frische Trüffeln lassen sich  im Kühlschrank zehn bis fünfzehn Tage lagern. Unter Umständen und je nach der Reife des Pilzes ist eine um einige Tage verlängerte Lagerung möglich. Für eine richtige Aufbewahrung sollen die Trüffel auf einer Schicht Küchenpapier in einem dicht geschlossenem Gefäss kühl gelagert werden.Das Papier, das dazu dient, die sich durch die Kondensation formende Feuchtigkeit aufzusaugen, sollte regelmässig gewechselt werden.

Durch das Aufbewahren in einem geschlossenen Gefäss wird vermieden, dass der starke Duft auf andere Lebensmittel im Kühlschrank übertragen wird.
Es ist wichtig, das Gefäss mehrmals täglich aufzumachen, um die Luft zu erneuern und damit die Trüffel “atmet”.